matplotlib のインストールでハマった
libpng 入っていたけど libpng-devel じゃないとダメでした。
これに気づかず30分無駄にしてしまった...
numpy で計算した話
完全個人メモです。後でちゃんと直します。
こんな数字が入ってるファイルがあって、それを読み取り 2 x 10 の配列にして平均値を出してみました。
4.36
4.07
4.14
3.57
4.33
4.23
4.86
4.71
4.86
3.85
4.36
4.07
4.14
3.57
4.33
4.23
4.79
4.79
4.64
3.85
で、ファイルを読んで計算
a = np.loadtxt('result.txt', delimiter ='\n')
a.resize *1
In [4]: a
Out[4]:
array([[ 4.36, 4.07, 4.14, 3.57, 4.33, 4.23, 4.86, 4.71, 4.86,
3.85],
[ 4.36, 4.07, 4.14, 3.57, 4.33, 4.23, 4.79, 4.79, 4.64,
3.85]])
でもこれを 10 x 2 にしたかったので
In [13]: b = a.T
In [14]: print b
[[ 4.36 4.36]
[ 4.07 4.07]
[ 4.14 4.14]
[ 3.57 3.57]
[ 4.33 4.33]
[ 4.23 4.23]
[ 4.86 4.79]
[ 4.71 4.79]
[ 4.86 4.64]
[ 3.85 3.85]]
In [19]: np.mean(b,1)
Out[19]:
array([ 4.36 , 4.07 , 4.14 , 3.57 , 4.33 , 4.23 , 4.825, 4.75 ,
4.75 , 3.85 ])
これで平均が上手く取れた気がする...
*1:2,10
Amazon Linux に numpy が入らなかった話
Amazon Linux に numpy 入れて使おうとしたら入らなかった。
RuntimeError: Broken toolchain: cannot link a simple C program
----------------------------------------
Cleaning up...
Command /usr/bin/python27 -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip_build_root/numpy/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-EH_PaM-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile failed with error code 1 in /tmp/pip_build_root/numpy
Traceback (most recent call last):
File "/usr/bin/pip", line 9, in <module>
load_entry_point('pip==1.5.6', 'console_scripts', 'pip')()
File "/usr/lib/python2.7/site-packages/pip-1.5.6-py2.7.egg/pip/__init__.py", line 185, in main
return command.main(cmd_args)
File "/usr/lib/python2.7/site-packages/pip-1.5.6-py2.7.egg/pip/basecommand.py", line 161, in main
text = '\n'.join(complete_log)
UnicodeDecodeError: 'ascii' codec can't decode byte 0xe3 in position 25: ordinal not in range(128)
あれこれ調べて pip じゃなくて普通に yum で入れたらすんなり入りました。しかしこれにはまだ続きがありました。
python - Installing numpy on Amazon EC2 - Stack Overflow
import してもそんなモジュールないですと言われる。
で、更に調べてたら以下のパッケージ入ってないとダメでした。
sudo yum -y install gcc-c++ python27-devel atlas-sse3-devel lapack-devel
ようやく入った。
Successfully installed numpy
Cleaning up...
[ec2-user@ip-172-16-0-247 ~]$ ipython
In [1]: import numpy